Аэросиноптические условия над центром европейской территории России 12 июня 2016 года определялась тыловой частью активного циклона, который перемещался от Новгорода через Бологое на Вологду. Накануне днем и прошедшей ночью в городе Москве прошли сильные дожди. В утренние часы в городе и области наблюдалась облачная погода с прояснениями при температуре воздуха +10°С, относительной влажности 95% и слабом западном ветре. В Московском регионе от поверхности земли до тропопаузы господствовали юго-западные ветры.  Ближайшие зоны осадков интенсивностью 0.1-0.3 мм/ч, связанные со слоисто-кучевой облачностью на вторичном холодном фронте в тылу циклона, располагались в Смоленской области и смещались в сторону Москвы со скоростью 40 км/ч.
В соответствии с планом полетов и фактическими метеоусловиями в 04:00 в воздух с аэродрома Чкаловский для разведки погоды и проведения воздействий в воздух был поднят самолет-метеолаборатория Як-42 (б/н № 42440) «Росгидромет».  В  период с 8 до 8:30 в воздух были подняты дополнительно два самолета, которые также приступили к засеву облачности к юго-западу от Москвы.
К 9 часам утра с прогревом приземного воздуха до +12°С на юго-западе Московской области началось интенсивное развитие конвективных ячеек. Зоны осадков с интенсивностью до 3 мм/ч перемещались со скоростью 40-45 км/час. По данным экипажей полеты в облаках сопровождались болтанкой и местами сильным обледенением.
Воздействия на слоисто-кучевые и кучево-дождевые облака (рис. 1) проводились до 23 часов всеми видами реагента. Несмотря на воздействия полностью исключить выпадение осадков на территории города не удалось.
Всего 12 июня 2016 г. было выполнено 13 самолёто-вылетов.

Рис. 1. Цифрокарты верхней границы радиоэхо облаков и интенсивности осадков в 14:00 МСК, 12 июня 2016 г.